Uz dugo očekivano Pikmin 3's puštanje na Wii U neizbježan, mnogi obožavatelji možda su se zapitali zašto 3DS izdanje nije u redu. Zaslon osjetljiv na dodir i stilus igranja izgleda kao prirodno mjesto za franšizu da ipak uspije. Kao odgovor na ovaj pojam, Shigeru Miyamoto je objasnio 4Gameru da je tim prethodno pokušao stvoriti Pikmin na 3DS-u i odlučio se protiv njega:
"Istina je da smo radili prototipove Pikmina za DS i 3DS, ali se pretvorilo u upravljanje jedinicom samo s olovkom na dodir i bez obzira na to što se nije činilo kao Pikmin.
Miyamoto je na kraju donio odluku da su kontrole igre najvažnije, a ručne konzole na dodir ne rade to pravično.
"Zaključili smo da je Pikmin igra koja se vrti oko akcije temeljene na svojim kontrolama i strategija se nalazi na vrhu. Iako postoje elementi koji su izgrađeni na strategiji, postoje i druge sveukupne stvari koje treba dobro razmotriti. Ovo cjelovito iskustvo je važan element Pikmina. "
Srećom, za razliku od neuspjelog prototipa, Miyamotova su očekivanja bila zadovoljena na Wii U. Prema legendarnom dizajneru igre odgovornoj za, između ostalog, Super Mario Bros. i Legenda o Zeldi, GamePad Wii U-a odgovara Pikmin 3 dobro.
'[Pikmin 3] na prvi pogled može biti teško, ali kada isprobate kontrole, to je jednostavno. Čak i ako smatrate da je upotreba pokazivača teška, postoji metoda kontrole koja koristi GamePad sličan prethodnim naslovima za GameCube koje bismo željeli koristiti. U tu svrhu, nadamo se da će ljudi to moći gledati kao bezbrižnu i jednostavnu akcijsku igru.
Pikmin 3 sada je dostupan u Europi, Australiji i Japanu, a bit će objavljen u Sjevernoj Americi 4. kolovoza.